Структура

Командване
Секция „Хидрографско осигуряване“
Секция „Картографско осигуряване“
Секция „Хидрологично осигуряване“
Секция „Подводни апарати“
Секция „Метеорологично осигуряване“
Секция „Радионавигационно осигуряване“
Хидрографски район Варна
- хидрографски катер „Капитан I ранг Борис Рогев”
Хидрографски район Бургас
- хидрографски катер „Контраадмирал Сава Иванов”
Отделение „Логистика“
7 фарови комплекса